Die Ursprünge sind sehr alt. Thomières und Saint-Pons waren ursprünglich zwei getrennte Gemeinden. Im vierten Jahrtausend v. J.-C., Männer ließen sich um die Quelle von Jaur nieder: Es ist die Geburt von Thomières. Der Bau einer Abtei auf der anderen Seite des Flusses Jaur im Jahr 936 durch den Grafen Raymond Pons von Toulouse markiert die Geburtsstunde von Saint-Pons. Sie werden auch ausgezeichnet: Thomières wurde "kleine Stadt", "Stadt der Armen" genannt, während Saint-Pons mit seiner Abtei und seinen Herrenhäusern "Magierstadt" genannt wurde.
Die Geschichte der Stadt ist eine Abfolge von Wachstums- und Zerstörungsperioden:
1170 wurden Teile der Stadt und des Klosters geplündert, sie erlitten schwere Zerstörungen, bis hin zur Kirche der Abtei 1318 zur Kathedrale umgebaut. Es folgten zwei Jahrhunderte der Entwicklung und des Wohlstands dank der Textilherstellung. Leider besetzten die Protestanten während der Religionskriege die Stadt für mehrere Monate und zerstörten erneut die meisten Gebäude im Dorf. Ende des 17. Jahrhunderts kehrte endlich Ruhe ein.
Im 19. Jahrhundert war Saint-Pont eine kleine Arbeiterstadt, die relativ friedlich blieb, das 20. Jahrhundert war keine blühende Zeit für das Dorf, das, wie in vielen französischen Regionen, den Niedergang seiner Textilindustrie erlebte.
Saint-Pons-de-Thomières liegt westlich des Departements Hérault und ist einem mediterranen Klima ausgesetzt, es wird von der Jaur, aber auch der Salesse, den Bächen von Cavenac, Fonclare, Saut und verschiedenen anderen kleinen Wasserläufen entwässert. Die Stadt ist Teil des Regionalen Naturparks Haut-Languedoc und verfügt über ein bemerkenswertes Naturerbe.
