Los orígenes son muy antiguos. Thomières y Saint-Pons eran originalmente dos municipios separados. En el cuarto milenio antes de Cristo. J.-C., los hombres se establecieron alrededor de la fuente de Jaur: es el nacimiento de Thomières. La construcción de una abadía al otro lado del río Jaur en 936 por el conde Raymond Pons de Toulouse, marca el nacimiento de Saint-Pons. También se distinguen: Thomières fue llamada "ciudad pequeña", "ciudad de los pobres", mientras que Saint-Pons con su abadía y sus mansiones fue llamada "ciudad de los magos".
La historia de la ciudad es una sucesión de períodos de crecimiento y destrucción:
En 1170 parte de la ciudad y el monasterio fueron saqueados, sufrieron graves destrozos, hasta el punto de que la iglesia de la abadía tuvo que ser reconstruida para convertirse en la catedral en 1318. Siguieron dos siglos de desarrollo y prosperidad gracias a la fabricación textil. Desafortunadamente, durante las guerras de religión, los protestantes ocuparon la ciudad durante varios meses y una vez más destruyeron la mayoría de los edificios del pueblo. A finales del siglo XVII, finalmente volvió la paz.
En el siglo XIX, Saint-Pont era un pequeño pueblo de clase trabajadora que permaneció relativamente tranquilo, el siglo XX no fue un período próspero para el pueblo que, como en muchas regiones francesas, vio decaer su industria textil.
Saint-Pons-de-Thomières situado al oeste del departamento de Hérault está expuesto a un clima mediterráneo, está drenado por el Jaur, pero también por el Salesse, los arroyos de Cavenac, Fonclare, Saut y varios otros pequeños cursos de agua. Incluida en el Parque Natural Regional de Haut-Languedoc, la ciudad cuenta con un patrimonio natural notable.