Die Gemeinde Chaînée-des-Coupis liegt in einem Netzwerk von Dörfern, die durch Straßen miteinander verbunden sind, die viele landwirtschaftlich genutzte Flächen und Wälder mit vielen Teichen durchqueren. Das Dorf besteht hauptsächlich aus einigen Häusern, die entlang einer Hauptverkehrsader, der "Großen Straße", verteilt sind. Dies verbindet das Dorf Pleure nach Südosten mit einer Gabelung nach Nordwesten, die nach Norden zum Dorf Gatey führt und von Nordwesten zur Abteilungsstraße 468 führt, die auch als Lons-le-Saunier-Straße bezeichnet wird.
Die Stadt liegt 25 km südlich von Dole und 55 km nördlich von Lons-le-Saunier.
