La chapelle de Flérier est le choeur conservé de l'ancienne église paroissiale démolie en 1825 pour servir de matériaux à la nouvelle, reconstruite au bourg de Taninges. La pelouse au-devant, correspond aux limites de l'ancien cimetière fermé en 1824.
On a retrouvé sur ce site des sépultures du Haut Moyen Âge. Lorsque la première église, d'époque burgonde, construite sur le hameau de Nâles est abandonnée, c'est à Flérier qu'est reconstruite l'église paroissiale. Déjà mentionnée dans les visites pastorales, au XIIIe siècle, elle présente des caractéristiques architecturales proches de celles de Mélan décelables dans les fenêtres du chevet, ou dans la voûte sur croisée d'ogive.
On devine encore sur les murs gouttereaux, la place des chapelles que les bourgeois de Taninges ou les confréries avaient fait construire.
