Point de passage obligé vers la Côte ou vers Paris, Pont-l'Évêque a toujours été un important lieu de passage et de commerce (les gabares descendaient la Touques).
Au Moyen Age, la ville devient un important siège administratif de la Vicomté d'Auge. Occupée par les Anglais pendant le XVe siècle, puis touchée par les Guerres de religion, Pont-l'Évêque connaît ensuite une ère de calme et de prospérité.
Le 24 août 1944, après 3 jours de combat, la ville détruite à 65% est libérée par les alliés.