L'origine du nom de Persquen provient du breton "perchen" signifiant perche, probablement en référence à la forme de la commune qui s'étend sur 7 kilomètres en longueur pour 3 de largeur.
A l'époque des Rohan, Persquen relève de la principauté de Guémené. Si les seigneuries y sont nombreuses, celle de Penvern est incontestablement la plus importante. Ses seigneurs, les Perenno, sont considérés comme les fondateurs de Persquen.
Vers 1735, Marion du Faouët s'établit durant environ 7 ans au village de Kerohel. C'est là qu'elle aurait choisi le refus de la misère en recourant au vol et au pillage des riches marchands et des pèlerins aisés.
Aujourd'hui, deux villages se démarquent par leur taille : le Pénéty et Saint-Vincent.
