Le village de Hunawihr se situe entre Riquewihr et Ribeauvillé et a été bâti sur les flancs d'un étroit vallon. Le nom du village provient du nom de l'épouse d'un des premiers seigneurs du pays Hune et du latin villare (ferme). Hune s'était mise au service des pauvres et lavait leur linge à la fontaine (fontaine Ste Hune, toujours existante), elle mourut en 679 et fut béatifiée le 15 avril 1520 par l'évêque de Bâle et par le pape Léon X.
A l'origine de l'église existait un ermitage qui se transforma au cours des siècles en église fortifiée telle qu'on la connait aujourd'hui. La construction de l'église telle qu'elle est aujourd'hui date des XIVe et XVe siècles.
Rattachés aux comtes de Montbéliard-Wurtemberg, les habitants de Hunawihr durent se convertir au protestantisme à la réforme. Il a fallu attendre Louis XIV et l'installation de sept familles catholiques (1687) pour que le culte catholique puisse être réintroduit dans l'église. Le simultanéum (les deux cultes catholique et protestant dans le même lieu) est toujours en pratique à ce jour. Et si par le passé la cohabitation ne s'est pas faite sans problèmes, aujourd'hui les deux communautés vivent plus sereinement.
Depuis toujours les crus de Hunawihr bénéficient d'une excellente réputation.