Die Gemeinde grenzt an die Schweiz, Jougne liegt im Doubs, im Herzen der Region Burgund-Franche-Comté. Es befindet sich auf einer Höhe von etwa 1000 Metern, an der Mündung des Jougne Cluse, einer der Pässe, die die Überquerung des Jura zwischen Frankreich und der Schweiz ermöglicht.
Das Gebiet von Jougne, das seit der galloromanischen Zeit frequentiert wurde, entwickelt sich um das elfte Jahrhundert herum. Die Stadt verläuft im Laufe der Jahrhunderte in burgundischen, schweizerischen oder französischen Händen gleichgültig. Mit der Ankunft der Eisenbahn in der zweiten Hälfte des neunzehnten Jahrhunderts gewann die Stadt an Bedeutung und entwickelte allmählich Bergtourismus und Wintersport.
Heute lebt Jougne sowohl von der traditionellen Landwirtschaft als auch vom Winter- und Sommertourismus.
