Monasterio fundado en la segunda mitad del siglo VII por Philippe de Tournus en la isla de Noirmoutier, la abadía de Saint-Philibert de Noirmoutier fue ocupada originalmente por monjes benedictinos que explotaban las marismas circundantes. Floreciente hasta que fue destruida por los sarracenos en 732, fue restablecida a principios del siglo IX por Luis el Piadoso, entonces rey de Aquitania.
Posteriormente, la Abadía de Noirmoutier fue saqueada muchas veces por los normandos, convirtiéndose en la segunda mitad del siglo IX en una base para las operaciones de los vikingos en el Loira. Luego, los monjes experimentaron un gran vagabundeo antes de volver a fundar una abadía en Tournus, en las Mâconnais, y ocasionalmente se llevaron las reliquias de su santo fundador.
De los antiguos edificios originales de Noirmoutier, solo queda hoy la cripta merovingia, que tiene lugar bajo la iglesia de Saint-Philibert en Noirmoutier-en-Île.
