Boofzheim se menciona por primera vez en el siglo 9 º bajo el nombre de Botesheim. Según algunos historiadores, en 401, una tribu alemánico se trasladó a la aldea bajo las órdenes de un jefe llamado Boffi o Boffo, de ahí el nombre de Boofzheim. Pero el descubrimiento de monedas romanas en bronce, en la aldea, sugiere la presencia romana.
Alrededor de 1221, el obispado de Estrasburgo y la Abadía de Saint-Etienne capturado la propiedad esencial de la aldea. En 1501, la familia se convierte en Mieg Boofzheim Señor y le da armas a la ciudad. En 1545, la Reforma fue introducida por Mieg familia y la iglesia de Saint-Etienne se transforma en un templo y luego entre 1687 y 1854, que servirá al mismo tiempo a ambas religiones. En 1855, el santuario se da a los católicos, la comunidad protestante que había construido su propia iglesia.
En 1636, en plena Guerra de los Treinta Años, los suecos destruyeron la aldea. Boofzheim debe su repoblación de inmigración de familias procedentes de Suiza y Holanda.
Boofzheim más sufrieron durante la Segunda Guerra Mundial, el pueblo ha sido devastado más de 30% y los habitantes fueron evacuados en 1939 a la Dordogne. El Boofzheim común y de Saint-Aubin-de-Cadelech (Dordogne) han confirmado su vínculo de amistad de pareja en agosto de 1986.