La catedral Saint-Jean de Besançon, erigida originalmente en el siglo IV, del que ha conservado una planta con dos ábsides opuestos, ha sufrido muchas transformaciones desde entonces. El edificio actual, consagrado a mediados del siglo XII, es obra del arzobispo Hugues de Salins. Una mezcla de estilos románico, gótico y barroco, el edificio es uno de los pocos en Francia que presenta dos coros opuestos.
En el interior, los visitantes pueden admirar una gran cantidad de pinturas clasificadas como Monumentos Históricos, así como un reloj astronómico o un altar circular en mármol blanco del siglo XI, la famosa Rosa de Saint-Jean.
Hoy catalogada como monumento histórico, la catedral Saint-Jean de Besançon también tiene varias capillas laterales como la de la Pila Bautismal con sus bahías de lancetas góticas o la de Notre-Dame des Jacobins que sirve de escaparate a la Virgen de Passignano, un lienzo del siglo XVII que se dice que fue pintado por Domenico Cresti conocido como Le Passignano.
También puede descubrir las magníficas vidrieras con temas florales del siglo XIX en el ábside de la Sábana Santa o la Piedad de Conrad Meyt del siglo XVI.