Il porto di Bastia apparve nell'antichità, ma fu solo nel 1661 che fu presa la decisione di costruire una talpa nel vecchio porto di Cardu (che in seguito divenne Port Cardo) e nel 1860 in modo che la roccia del leone fu demolita. che costituiva un ostacolo per la navigazione sicura quando ci si avvicinava al porto.
Gli sviluppi si susseguiranno per tutto il XX secolo e ancora oggi bacini, banchine e pontili sono oggetto di estensione.
Tuttavia, una svolta fondamentale è stata l'entrata in servizio di un molo dedicato ai traghetti per auto nel 1975.
Infatti, ad oggi, in termini di traffico passeggeri, il porto di Bastia è il più trafficato dei porti francesi del Mediterraneo e il secondo del Paese dietro a Calais: altro 2,2 milioni di passeggeri annuali registrati a Bastia contro i 15 milioni di Calais.
Oggi, lungo tutto il lungomare della città, si trova il Porto Vecchio da sud a nord (dove alcuni pesca e yachting), il porto commerciale (traffico passeggeri e merci), che è ovviamente il più grande e il meglio attrezzato pur essendo vicino al centro (parcheggi, stazione ferroviaria, comfort e spazi verdi, terminal) ed infine la marina di Toga che ricopre anche il territorio di Ville-di-Pietrabugno.
Per quanto riguarda il traffico passeggeri, collegamenti regolari (giornalieri per i principali) collegano Bastia a Marsiglia, Tolone e Nizza (in Francia) e Savona, Genova, Livorno e Plombino (in Italia).
Un punto informazioni è operativo nella hall del terminal, accessibile tutti i giorni. Contatto allo +33 4 95 55 25 85.
Sono inoltre stabilite non meno di quattro società che forniscono collegamenti con il continente. Questi sono Corsica Ferries (tel: +33 4 95 32 95 95), La Méridionale (tel: +33 4 95 55 25 55), Moby Lines (tel: +33 4 95 34 84 94), Corsica Linea (telefono: 0825 88 80 88).