Inscrite aux Monuments Historiques, l'église de Samoëns prend place dans la commune éponyme, au cœur du département de la Haute-Savoie. Détruite dans la seconde moitié du XVe siècle lors de l'invasion des Bernois, elle est reconstruite peu après et devient collégiale du diocèse de Genève au XVIe siècle.
De l'église d'origine, il ne subsiste que la partie inférieure de la tour-clocher, du XIIIe siècle, et la chapelle Saint-Claude du XVe siècle. Désaffectée à la Révolution française, elle redevient église au début du XIXe siècle avant d'être rénovée dans les années 1910 grâce à la générosité de Marie-Louise Cognacq-Jaÿ, créatrice de La Samaritaine à Paris. L'intérieur de l'église de son village natal est alors décoré dans le style de l'époque, d'inspiration néo-gothique.
On peut notamment y admirer une chaire en bois de style Louis XIII, un bénitier du milieu du XIXe siècle, ou encore une Vierge à l'Enfant de style baroque dans le style des statues savoyardes du XVIIIe siècle. Selon la légende locale, elle aurait les traits d'Anne d'Autriche et du futur roi Louis XIV.