Implantée sur les rives de l'étang de Thau, le plus grand des étangs languedociens, Balaruc-les-Bains a la particularité de former une presqu'île orientée en direction de Sète distante de 7 km. Montpellier se trouve à 28 km au Sud-Ouest. Entre la garrigue et la mer, au coeur du bassin de Thau, Balaruc-les-Bains est située sur une presqu'île qui pénètre les eaux de cet étang de 20 km que l'on considère ici comme une "petite mer".
Cette situation privilégiée lui confère un micro-climat marin atténué où le soleil est omniprésent (2600 heures d'ensoleillement par an), la température moyenne élevée. Le bon air marin, la proximité de la Méditerranée et de l'étang de Thau sont des atouts exceptionnels pour Balaruc-les-Bains.
La station thermale de Balaruc-les-Bains, avec deux indications thérapeutiques (rhumatologie et phlébologie), est classée première station thermale de France.