Boofzheim wordt voor het eerst in de 9e eeuw onder de naam van Botesheim. Volgens sommige historici, in 401, een stam Alemannisch verplaatst naar het dorp onder de bevelen van een chef genaamd Boffi of Boffo, vandaar de naam Boofzheim. Maar de ontdekking van de Romeinse munten in brons, in het dorp, stelt de Romeinse aanwezigheid.
Rond 1221, het bisdom Straatsburg en de Abdij van Saint-Etienne veroverde de essentiële eigenschap van het dorp. In 1501, het gezin wordt Mieg Heer Boofzheim en geeft haar armen naar de stad. In 1545 de Reformatie werd ingevoerd door Mieg familie en de kerk Saint-Etienne wordt omgezet in een tempel en vervolgens tussen 1687 en 1854, zal het tegelijkertijd dienen om beide religies. In 1855 is het heiligdom gegeven aan de katholieken, de protestantse gemeenschap die had zijn eigen kerk gebouwd.
In 1636, in volle Dertigjarige Oorlog, de Zweden verwoest het dorp. Boofzheim dankt haar uitzet immigratie van gezinnen uit Zwitserland en Nederland.
Boofzheim meeste leed tijdens de Tweede Wereldoorlog, heeft het dorp is verwoest meer dan 30% en de bewoners werden geëvacueerd in 1939 aan de Dordogne. De gemeenschappelijke Boofzheim en Saint-Aubin-de-Cadelech (Dordogne) hebben bevestigd dat zij band van vriendschap door pairing in augustus 1986.