Het Bonaparte-museum in Auxonne is momenteel gesloten vanwege herstructurering en restauratie van de collecties en profiteert van het label Musée de France. Het Bonaparte Museum, opgericht in 1863, in de stad waar Napoleon Bonaparte een opleiding tot artillerist volgde, was oorspronkelijk een klein museum gewijd aan de schilderkunst. Het kreeg zijn huidige naam aan het einde van de jaren 40.
In 1955, het Bonaparte-museum met onder meer bustes van Napoleon I, militaire beeldjes of tafelservies van Napoleon III.
Het werd in 1970 geïnstalleerd in de Notre-Dame du Château-toren en vertelt in al zijn ruimtes de militaire geschiedenis van de stad, de lokale geschiedenis en de geschiedenis van Napoleon I en Napoleon III.