L'origine del nome di Persquen deriva dal bretone "perchen" che significa pesce persico, probabilmente in riferimento alla forma della città che si estende per 7 chilometri di lunghezza e 3 di larghezza.
Al tempo dei Rohan, Persquen apparteneva al principato di Guémené. Se le signorie sono numerose lì, quella di Penvern è senza dubbio la più importante. I suoi signori, i Perenno, sono considerati i fondatori di Persquen.
Intorno al 1735, Marion du Faouët si stabilì per circa 7 anni nel villaggio di Kerohel. Era lì che avrebbe scelto il rifiuto della povertà ricorrendo al furto e al saccheggio dei ricchi mercanti e dei pellegrini benestanti.
Oggi, due paesi si distinguono per le loro dimensioni: Pénéty e Saint-Vincent.