Situata ai piedi del Revermont, incastonata in fondo a una valle tra due colline del Giura che scendono dolcemente verso la pianura della Bresse, senza sbocco sul mare nel dipartimento del Giura, Cuiseaux è la città più orientale della Saône-et-Loire.
Le sue origini sono molto antiche. A 2 chilometri a nord del paese si trova il sito preistorico di La Balme. Il suo toponimo sarebbe di origine celtica. Occorre attendere il 1107 affinché l'esistenza di Cuiseaux sia attestata da scritti. I signori di Cuisel appartenevano a una famiglia potente, probabilmente dalla casa di contea della Borgogna. La sua posizione privilegiata ne ha favorito lo sviluppo. Cuisel era una città castello ben fortificata e la sua popolazione si dedicava principalmente ad attività agricole. La vite era uno dei suoi principali asset ma la sua economia si aprì anche all'artigianato.